Standardization of metagenomics-based microbial profiling

In the past decade, research into human microbiome-based therapeutics and diagnostics has accelerated the widespread availability of next-generation DNA sequencing technologies that comprehensively profile complex microbiota through metagenomic approaches. However, measurements generated by different laboratories often display large variability due to protocol dependent biases introduced at each step in the workflow.

Dr. Dieter Tourlousse, National Institute of Advanced Industrial Science and Technology, and collaborators from the Japan Microbiome Consortium, have established standard operating procedures (SOPs) for metagenomics-based microbiome profiling of human fecal samples. Join this webinar to hear Dr. Tourlousse discuss the steps that were taken to set the SOPs. He will also share how he expects the widespread uptake of the SOPs, which include the QIAseq FX DNA Library Kit for library construction and best-practice guidelines, to increase the accuracy of NGS-based metagenome profiling results across the microbiome field.

ITALIANO

Obiettivi chiave di apprendimento

Comprendere la validazione e la standardizzazione dell'estrazione del DNA

Ottieni informazioni dettagliate sui metodi di costruzione della libreria per le misurazioni del microbioma fecale umano basate sulla metagenomica

Esplora come confrontare e valutare la riproducibilità e la trasferibilità dei protocolli convalidati in uno studio interlaboratorio basato sul settore

Informazione

Standardizzazione del profilo microbico basato sulla metagenomica

Negli ultimi dieci anni, la ricerca sulle terapie e sulla diagnostica basate sul microbioma umano ha accelerato la diffusa disponibilità di tecnologie di sequenziamento del DNA di prossima generazione che profilano in modo completo il microbiota complesso attraverso approcci metagenomici. Tuttavia, le misurazioni generate da laboratori diversi mostrano spesso un'ampia variabilità a causa di errori dipendenti dal protocollo introdotti in ogni fase del flusso di lavoro.

Il dottor Dieter Tourlousse, Istituto nazionale di scienza e tecnologia industriale avanzata, ed i collaboratori del Japan Microbiome Consortium, hanno stabilito procedure operative standard (SOP) per la profilazione del microbioma basata sulla metagenomica di campioni fecali umani. Partecipa a questo webinar per ascoltare il Dr. Tourlousse discutere i passi compiuti per impostare le SOP. Condividerà inoltre come si aspetta che l'adozione diffusa delle SOP, che includono il kit QIAseq FX DNA Library per la costruzione di librerie e linee guida sulle migliori pratiche, aumenti l'accuratezza dei risultati della profilazione del metagenoma basata su NGS nel campo del microbioma.