"Miniaturized high-throughput transcriptomics for preclinical drug discovery" / 

Questo per riconoscimento

Giuseppe Cotellessa

Ha partecipato ad un webinar di un'ora ed ad una sessione di domande e risposte intitolata

"Trascrittomica miniaturizzata ad alto rendimento per la scoperta preclinica di farmaci" / #22/6/2023 ter

Key learning objectives

• Discover how DRUG-Seq can be used to generate large-scale RNA sequencing data that may accelerate pharmacological profiling of the compound library
• Learn about the combined DRUG-Seq workflow of miniatured high-throughput drug screening and transcriptomics using the Echo 655T acoustic liquid handler and the Biomek i7 Automated Workstation

Miniaturized high-throughput transcriptomics for preclinical drug discovery

Biopharmaceutical companies utilize high-throughput drug screens to understand targets of regulators in biological processes and to identify new pre-clinical lead molecules. Screening through high-throughput transcriptomic profiling enables a global view of gene regulation in a model-agnostic format. Utilizing DRUG-Seq to generate large-scale RNA sequencing data may accelerate pharmacological profiling of the compound library (e.g., mechanisms of action, and off-target profiling).

Miniaturizing drug screening helps to accelerate throughput while simultaneously reducing costs. In this webinar, Ian Shoemaker and Kelly Parliament from Beckman Coulter Life Sciences will share how the Echo® 655T instrument, an acoustic liquid handler, allows for miniaturization of the drug screen process through the rapid and accurate transfer of compounds at volumes as low as 2.5 nL without the use of plastic tips.

They will also explain how bulk RNA barcoding and sequencing (BRB-seq) enables the use of high-throughput RNA library preparation and sequencing by drastically reducing price and preparation time through the utilization of RNA barcoding and multiplexed library preparation. BRB-seq prepares 3’ RNA sequencing libraries suited for differential gene expression analysis. Explore how the MERCURIUS™ Cell Lysate BRB-seq Library Preparation kit enables the use of crude cell lysates directly in reverse transcription steps, thus saving cost and time. The entire automated BRB-seq workflow from cell lysis to sequencing-ready DNA libraries can be completed in seven hours for 96 or 384 samples on the Biomek i7 dual hybrid workstation.

ITALIANO

Principali obiettivi di apprendimento

Scopri come DRUG-Seq può essere utilizzato per generare dati di sequenziamento dell'RNA su larga scala che possono accelerare la profilazione farmacologica della libreria di composti.

Scopri il flusso di lavoro DRUG-Seq combinato di screening di farmaci ad alta produttività in miniatura e trascrittomica utilizzando il gestore di liquidi acustici Echo 655T e la stazione di lavoro automatizzata Biomek i7

Informazione

Trascrittomica miniaturizzata ad alto rendimento per la scoperta preclinica di farmaci

Le aziende biofarmaceutiche utilizzano schermi di farmaci ad alto rendimento per comprendere gli obiettivi dei regolatori nei processi biologici e per identificare nuove molecole guida precliniche. Lo screening attraverso la profilazione trascrittomica ad alto rendimento consente una visione globale della regolazione genica in un formato indipendente dal modello. L'utilizzo di DRUG-Seq per generare dati di sequenziamento dell'RNA su larga scala può accelerare la profilazione farmacologica della libreria di composti (ad esempio, meccanismi di azione e profilazione fuori bersaglio).

La miniaturizzazione dello screening dei farmaci aiuta ad accelerare la produttività riducendo contemporaneamente i costi. In questo webinar, Ian Shoemaker e Kelly Parliament di Beckman Coulter Life Sciences condivideranno come lo strumento Echo® 655T, un gestore di liquidi acustico, consente la miniaturizzazione del processo di screening dei farmaci attraverso il trasferimento rapido e accurato di composti a volumi fino a 2,5 nL senza l'uso di punte in plastica.

Spiegheranno anche in che modo il codice a barre e il sequenziamento dell'RNA di massa (BRB-seq) consentono l'uso della preparazione e del sequenziamento della libreria di RNA ad alto rendimento riducendo drasticamente il prezzo ed il tempo di preparazione attraverso l'utilizzo del codice a barre dell'RNA e la preparazione della libreria multiplex. BRB-seq prepara librerie di sequenziamento dell'RNA 3' adatte per l'analisi dell'espressione genica differenziale. Scopri come il kit di preparazione della libreria MERCURIUS™ Cell Lysate BRB-seq consente l'uso di lisati cellulari grezzi direttamente nelle fasi di trascrizione inversa, risparmiando così tempo e denaro. L'intero flusso di lavoro BRB-seq automatizzato, dalla lisi cellulare alle librerie di DNA pronte per il sequenziamento, può essere completato in sette ore per 96 o 384 campioni sulla stazione di lavoro ibrida doppia Biomek i7.