"Exploring topics in sample QC for NGS workflows: Solutions for special challenges in NGS workflows" / 

Questo per riconoscimento

Giuseppe Cotellessa

Ha partecipato ad un webinar di un'ora ed ad una sessione di domande e risposte intitolata

"Esplorazione degli argomenti nel QC di esempio per i flussi di lavoro NGS: soluzioni per sfide speciali nei flussi di lavoro NGS" / #23/5/2023 bis

Key learning objectives

• Learn how to examine sample molarity for improved visual representation of sequencing read number
• Understand how to use data visualization in moles and smear analysis to conduct informed size selection experiments prior to long-read sequencing
• Discover why detection of adapter dimers in NGS libraries is needed during NGS library quality control stages
• Learn how to obtain valuable NGS library quality data using Agilent automated electrophoresis instruments

Exploring topics in sample QC for NGS workflows: Solutions for special challenges in NGS workflows

During next-generation sequencing (NGS) library preparation, examining DNA sample molarity may provide better visualization for long-read sequencing over traditional sample mass measurements. Part one of the webinar will discuss how the Agilent Femto Pulse system and Agilent ProSize data analysis software can be used to determine sample molarity to predict long-read sequencing read lengths.

The presence of adapter dimers in a NGS library can have detrimental effects on downstream sequencing results, such as reduced output, lower diversity, and decreased genome coverage. Part two of this webinar highlights the sensitivity of the Agilent automated electrophoresis portfolio to detect adapter dimers and provide valuable library quality data.

ITALIANO

Principali obiettivi di apprendimento

Scopri come esaminare la molarità del campione per una migliore rappresentazione visiva del numero di lettura del sequenziamento

Comprendere come utilizzare la visualizzazione dei dati nell'analisi dei nei e dello striscio per condurre esperimenti di selezione delle dimensioni informate prima del sequenziamento a lettura lunga

Scopri perché è necessario il rilevamento dei dimeri dell'adattatore nelle librerie NGS durante le fasi di controllo della qualità delle librerie NGS

Scopri come ottenere preziosi dati di qualità della libreria NGS utilizzando gli strumenti per l'elettroforesi automatizzata Agilent

Informazione

Esplorazione degli argomenti nel QC di esempio per i flussi di lavoro NGS: soluzioni per sfide speciali nei flussi di lavoro NGS

Durante la preparazione della libreria di sequenziamento di nuova generazione (NGS), l'esame della molarità del campione di DNA può fornire una migliore visualizzazione per il sequenziamento a lettura lunga rispetto alle tradizionali misurazioni della massa del campione. La prima parte del webinar discuterà di come utilizzare il sistema Agilent Femto Pulse ed il software di analisi dei dati Agilent ProSize per determinare la molarità del campione per prevedere le lunghezze di lettura del sequenziamento a lettura lunga.

La presenza di dimeri dell'adattatore in una libreria NGS può avere effetti dannosi sui risultati del sequenziamento a valle, come output ridotto, minore diversità e ridotta copertura del genoma. La seconda parte di questo webinar evidenzia la sensibilità del portafoglio di elettroforesi automatizzata Agilent per rilevare i dimeri dell'adattatore e fornire preziosi dati sulla qualità della libreria.