This is to acknowledge that Giuseppe Cotellessa Attended a one-hour webinar and Q&A session entitled "A lesson from COVID-19 on the dangers of using Cq to quantify nucleic acids" /  Questo per riconoscere che Giuseppe Cotellessa ha partecipato a un webinar di un'ora e una sessione di domande e risposte dal titolo "Una lezione dal COVID-19 sui pericoli dell'uso di Cq per quantificare gli acidi nucleici"  / # 6-1-2022

This is to acknowledge that

Giuseppe Cotellessa

Attended a one-hour webinar and Q&A session entitled.

A lesson from COVID-19 on the dangers of using Cq to quantify nucleic acids

 January 6th, 2022

Key Learning Outcomes

Choice of unit is important if medical

practitioners and

 researchers want to quantify virus in pati

ents to guide patient

 stratification or if national or internationa

l organizations are to set performance

 targets for diagnostic tests

The Cq or Ct value should not be used for 

this purpose: it can

 be precise but is highly irreproducible

 (varying by over a 1000

 fold). It is comparable to trying to age

 children by their height.

 This can be immediately recognized as an

not sensible idea, yet for the analogy to

 work in this example the population of

 children would vary in height from 5 cm 

to 50 m.

The R value will likely impact on the

 performance of less

 analytically sensitive tests. So deploying a

 lateral flow test as a

 screening tool mat be better when the 

pandemic is growing 

 than when it is more stable or decreasing:

 this is an important consideration when

 evaluating test performance.

This work illustrates how the quantity of 

RNA (or DNA) matters

 even if you are only interested in the 

presence or absence of a

 virus. Consequently SARS could teach us

 a lot about other

 molecular diagnostic tools, both in 

infectious diseases but also

 wider such as detection of actionable

mutations when treating cancer.

ITALIANO

Questo è per riconoscere che

Giuseppe Cotellessa

Ha partecipato a un webinar di un'ora ed ad una sessione di domande e risposte dal titolo

Una lezione dal COVID-19 sui pericoli dell'uso di Cq per quantificare gli acidi nucleici

6 gennaio 2022

Principali risultati di apprendimento

La scelta dell'unità è importante se medici e ricercatori vogliono quantificare il virus nei pazienti per guidare la stratificazione dei pazienti o se le organizzazioni nazionali o internazionali devono stabilire obiettivi di prestazione per i test diagnostici

Il valore Cq o Ct non dovrebbe essere utilizzato per questo scopo: può essere preciso ma è altamente irriproducibile (variabile di oltre 1000 volte). È paragonabile a cercare di invecchiare i bambini in base alla loro altezza. Questa può essere immediatamente riconosciuta come un'idea non sensata, ma affinché l'analogia funzioni in questo esempio la popolazione dei bambini varierebbe in altezza da 5 cm a 50 m.

Il valore R avrà probabilmente un impatto sull'esecuzione di test meno sensibili dal punto di vista analitico. Quindi l'implementazione di un test a flusso laterale come strumento di screening è migliore quando la pandemia è in crescita rispetto a quando è più stabile o in diminuzione: questa è una considerazione importante quando si valutano le prestazioni del test.

Questo lavoro illustra come la quantità di RNA (o DNA) conta anche se sei interessato solo alla presenza o assenza di un virus. Di conseguenza la SARS potrebbe insegnarci molto su altri strumenti diagnostici molecolari, sia nelle malattie infettive, ma anche più ampi come l'individuazione di mutazioni attivabili nel trattamento del cancro.